一般来说，代理记账公司做账的全套流程，通常按照如下步骤来进行：
1、签订合同
与委托企业签订财务外包代理记账合同，确定服务项目及费用。
2、票据交接
由企业将每月做账票据送至代理记账公司，或由代理记账公司安排外勤会计上门取票，然后对企业各类原始票据和凭证进行初步整理。对于新设立的企业来说，代理记账公司还可以帮助它们完成开立会计账户，建立会计核算体系，编制会计分录等工作。
3、会计做账
由代理记账公司记账会计对企业票据进行进一步整理，对票据存在的问题与企业及时沟通，然后进行会计核算、账务处理、税款计算。随后，在所有的账务审核无误后填制税务纳税申报表，税收缴款书，并就纳税情况与企业沟通。同时，还会帮助新设企业办理税务登记、减免税手续，并提供一般纳税人申请、发票领购等服务。
4、纳税申报
纳税申报一般由专人负责。其申报方式主要有两种。一种是由代理记账会计直接进行网上申报。另一种是在遇到一些需要前往税务部门现场办理的事宜时，代理记账机构外勤会计也可以前往税务大厅进行申请。
5、企业回访
在完成税务申报工作后，代理记账公司会返还给企业税单、财务报表、纳税申报等材料，并与企业出纳人员对账，对下月财务工作做出安排。此外，代理记账会计还会及时反馈给企业各类财税较新政策、通知等。

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